二价HPV疫苗可预防由16和18两个基因型的HPV病毒感染引起的宫颈癌及相关癌前病变(约占所有宫颈癌病例的七成)。四价HPV疫苗除了预防由16和18基因型的HPV病毒感染引起的宫颈癌及相关癌前病变外，还可以预防由6和11两个基因型的HPV病毒感染引起的肛门和生殖器疣(约占所有肛门和生殖器疣病例的九成)。
九价HPV疫苗是四价HPV疫苗的升级版，除了上述的6、11、16、18基因型外，还可以预防31、33、45、52和58这五个基因型的HPV病毒感染引起的宫颈癌及相关癌前病变(约占所有宫颈癌病例的九成)
| hpv疫苗二价四价九价区别一览 | |
| 二价HPV疫苗 | 预防包括HPV16型、18型两种病毒 |
| 四价HPV疫苗 | 预防包括HPV6型、11型、16型、18型四种病毒 |
| 九价HPV疫苗 | 预防包括HPV6型、11型、16型、18型、31型、33型、45型、52型、58型九种病毒 |
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